NS perbedaan utama antara hibridisasi koloni dan plak adalah bahwa hibridisasi koloni adalah metode yang digunakan dalam pemilihan koloni bakteri dengan gen yang diinginkan sedangkan hibridisasi plak adalah metode pemilihan fag dengan gen yang diinginkan. Selanjutnya, hibridisasi koloni dapat digunakan dalam penyaringan perpustakaan berbasis plasmid atau kosmid sementara hibridisasi plak dapat digunakan dalam penyaringan perpustakaan fag.

Hibridisasi koloni dan plak adalah dua teknik yang digunakan dalam penyaringan perpustakaan genomik atau cDNA. Mereka juga disebut angkat koloni dan pengangkatan plak masing-masing.

Koloni, Hibridisasi Koloni, Penyaringan Perpustakaan, Plak, Hibridisasi Plak

Apa itu Hibridisasi Koloni?

Hibridisasi koloni adalah metode penyaringan yang digunakan dalam pemilihan koloni bakteri dengan urutan DNA yang diinginkan. Disebut juga hibridisasi koloni blot, pengangkatan koloni atau pelapisan replika. Ini memungkinkan penyaringan koloni berlapis dengan kepadatan tinggi. Prosedur asli hibridisasi koloni pertama kali dikembangkan oleh Grunstein dan Hogness. Pertama, koloni bakteri dapat diubah menjadi membran dan koloni bakteri dilisiskan, memperlihatkan asam nukleat. Kemudian, asam nukleat yang terpapar difiksasi ke membran dengan mendenaturasinya dan dihibridisasi dengan probe radioaktif.

Gambar 1: Metode Hibridisasi Koloni

Koloni adalah sekelompok bakteri yang dikembangkan dari sel bakteri tunggal melalui reproduksi aseksual. Oleh karena itu, semua sel bakteri dalam koloni tertentu memiliki susunan genetik yang sama serta materi genetik yang diubah. Umumnya, bakteri ditransformasikan dengan bantuan vektor plasmid atau kosmid.

Apa itu Hibridisasi Plak?

Hibridisasi plak adalah metode penyaringan untuk fag rekombinan. Ini merupakan modifikasi dari hibridisasi koloni oleh Benton dan Devis pada tahun 1977. Metode ini disebut juga pengangkatan plak. Prosedur hibridisasi plak mirip dengan prosedur hibridisasi koloni dan plak diangkat dengan mengontakkannya ke membran nitroselulosa. Asam nukleat kemudian diekspos dan difiksasi ke membran, hibridisasi dengan probe yang diinginkan.

Gambar 2: Plak pada Piring Agar

Plak adalah zona bening pada lempeng agar yang dihasilkan oleh bakteriofag tertentu melalui lisis sel bakteri pada area tersebut. Karena sedikitnya jumlah DNA yang ditransfer ke membran nitroselulosa, hibridisasi plak menghasilkan lebih sedikit sinyal latar belakang.

Persamaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak

Perbedaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak

Definisi

Hibridisasi koloni mengacu pada metode pemilihan koloni bakteri dengan gen yang diinginkan sedangkan hibridisasi plak mengacu pada metode penyaringan yang digunakan dalam identifikasi fag rekombinan.

Dikembangkan oleh

Hibridisasi koloni pertama kali dikembangkan oleh Grunstein dan Hogness sedangkan hibridisasi plak pertama kali dikembangkan oleh Benton dan Devis pada tahun 1977.

Jenis Perpustakaan

Hibridisasi koloni melibatkan identifikasi perpustakaan berbasis plasmid atau kosmid sementara hibridisasi plak melibatkan identifikasi perpustakaan fag.

Jumlah Lift

Koloni dapat diangkat untuk satu kali sementara plak dapat diangkat beberapa kali.

Sinyal Latar Belakang

Kesimpulan

Hibridisasi koloni adalah metode penyaringan koloni bakteri di perpustakaan yang dihasilkan dengan vektor plasmid atau kosmid. Di sisi lain, hibridisasi plak adalah metode penyaringan bakteriofag di perpustakaan fag. Perbedaan utama antara hibridisasi koloni dan plak adalah jenis perpustakaan yang disaring dalam setiap metode.

Referensi:

1. Kaksonen, Anna. “Pendekatan Molekuler untuk Analisis Komunitas Mikroba.” Leaching – BioMineWiki, 20 April 2006, Tersedia di sini2. Dale, JW, dan PJ Greenaway. “Identifikasi Fag Rekombinan dengan Hibridisasi Plak.” Metode dalam Biologi Molekuler (Clifton, N.J.), Perpustakaan Kedokteran Nasional AS, Tersedia Di Sini

Gambar Courtesy:

1. “Hibridisasi Blot” Oleh Kaksonen – http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 2. “M. plakat smegmatis” Oleh Wazzzup7up - Karya sendiri (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia