Perbedaan Utama – Genomik vs Proteomik

Genomik, proteomik, dan metabolomik adalah bidang yang terlibat dalam studi dan klasifikasi makhluk hidup berdasarkan genomnya, produk protein yang disintesis berdasarkan instruksi genetik, dan jenis molekul yang dimetabolisme, masing-masing. Genomik dan proteomik adalah bidang yang terkait erat. NS perbedaan utama antara genomik dan proteomik adalah bahwa genomik adalah studi tentang seluruh rangkaian gen dalam genom sel sedangkan proteomik adalah studi tentang seluruh rangkaian protein yang diproduksi oleh sel. Metabolomik, di sisi lain, adalah studi tentang seluruh rangkaian senyawa dengan berat molekul rendah yang berfungsi sebagai substrat dan produk sampingan dari reaksi enzimatik sel.

Area Utama yang Dicakup

1. Apa itu Genomik? – Definisi, Teknik, Klasifikasi 2. Apa itu Proteomik? – Definisi, Teknik, Klasifikasi 3. Apa Persamaan Antara Genomik dan Proteomik? – Garis Besar Fitur Umum 4. Apa Perbedaan Antara Genomik dan Proteomik? – Perbandingan Perbedaan Kunci

Istilah Kunci: Gen, Genomik, Proyek Genom Manusia (HGP), Proyek Proteom Manusia (HPP), Protein, Proteom, Proteomik

Apa itu Genomik?

Genomics mengacu pada studi tentang seluruh set gen dalam genom. Genom adalah kumpulan lengkap informasi genetik suatu organisme, terutama terdiri dari DNA. Teknik throughput tinggi digunakan dalam genomik untuk memetakan, mengurutkan, dan menganalisis genom. Teknik-teknik yang terlibat dalam genomik termasuk strategi sekuensing gen seperti sekuensing gen terarah, sekuensing senapan seluruh genom, konstruksi tag urutan terekspresikan (EST), identifikasi polimorfisme nukleotida tunggal (SNP), dan analisis dan interpretasi data sekuensing menggunakan perangkat lunak yang berbeda dan database. Langkah-langkah utama dari urutan senapan ditunjukkan pada gambar 1.

Gambar 1: Urutan Shotgun Lingkungan (ESS)Pengambilan Sampel, (B) Partikel Penyaringan, (C) Ekstraksi dan Lisis DNA, (D) Kloning dan Pustaka, (D) Sequencing, (E) Sequence Assembly

Dua bidang utama genomik adalah genomik struktural dan genomik fungsional. Di dalam genomik struktural, struktur dan posisi relatif gen dipelajari saat genomik fungsional, fungsi atau peran gen dalam mengatur aktivitas metabolisme dipelajari. Proyek Pengurutan Genom adalah perkembangan terbaru dalam genomik. Proyek Genom Manusia (HGP) selesai pada tahun 2003. Tujuan dari Proyek Genom Manusia adalah:

Selain genom manusia, genom tikus dan padi juga menjadi sasaran studi genomik.

Apa itu Proteomik?

Proteomik mengacu pada studi tentang seluruh rangkaian protein yang diproduksi oleh sel. Proteom adalah set lengkap protein yang diproduksi oleh sel. Dalam proteomik, karakterisasi struktur 3D dan fungsi protein dilakukan dengan menggunakan metode throughput tinggi. Teknik yang terlibat dalam proteomik termasuk ekstraksi dan pemisahan elektroforesis protein, pencernaan protein dengan menggunakan tripsin menjadi fragmen kecil, penentuan urutan asam amino dengan spektrometri massa, dan identifikasi protein menggunakan informasi dalam database protein. Selain itu, struktur 3D protein dapat diprediksi menggunakan metode berbasis perangkat lunak. Ekspresi protein dapat dipelajari dengan mikroarray protein. Peta jaringan protein dapat dikembangkan untuk menentukan interaksi protein-protein. Berbagai fenomena proteomik ditunjukkan pada Gambar 2.

Gambar 2: Proteomik

Produk protein dari gen genom manusia dipelajari selama Proyek Proteome Manusia (HPP). Salah satu tujuan utama Proyek Proteome Manusia adalah untuk mengidentifikasi protein yang terlibat dalam penyakit utama.

Persamaan Antara Genomik dan Proteomik

Perbedaan Antara Genomik dan Proteomik

Definisi

Genomik: Genomics mengacu pada studi tentang seluruh set gen dalam genom.

Proteomik: Proteomik mengacu pada studi tentang seluruh rangkaian protein yang diproduksi oleh sel.

Fenomena

Genomik: Genomik melibatkan pemetaan, pengurutan, dan analisis genom.

Proteomik: Proteomik melibatkan struktur 3D dan fungsi protein, dan interaksi protein-protein.

Klasifikasi

Genomik: Dua jenis genomik adalah genomik struktural dan genomik fungsional.

Proteomik: Tiga jenis proteomik adalah proteomik struktural, fungsional, dan ekspresi.

Area Penting

Genomik: Proyek pengurutan genom seperti Proyek Genom Manusia adalah bidang penting genomik.

Proteomik: Pengembangan database proteome seperti SWISS-2DPAGE dan pengembangan perangkat lunak untuk desain obat berbantuan komputer adalah area penting dari proteomik.

Kesimpulan

Genomik dan proteomik adalah dua bidang ilmiah yang digunakan dalam studi organisme. Genomics adalah studi tentang seluruh set gen dalam suatu organisme sedangkan proteomik adalah studi tentang seluruh set protein yang diproduksi oleh sel. Perbedaan utama antara genomik dan proteomik adalah kriteria masing-masing bidang selama studi organisme.

Referensi:

1. Griffiths, Anthony JF. “Genomik: gambaran umum.” Sebuah Pengantar Analisis Genetika. Edisi ke-7., Perpustakaan Kedokteran Nasional AS, 1 Januari 1970, Tersedia di sini.2. Tanpa batas. “Genomik dan Proteomik.” Genomik dan Proteomik | Biologi Tanpa Batas, Tersedia di sini.3. Graves, Paul R., dan Timothy A. J. Haystead. “Panduan Ahli Biologi Molekuler untuk Proteomik.” Ulasan Mikrobiologi dan Biologi Molekuler, American Society for Microbiology, Maret 2002, Tersedia di sini.

Gambar Courtesy:

1. "Pengurutan senapan lingkungan" Oleh John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC BY 2.5) melalui Commons Wikimedia2. “Proteomik” Oleh Xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggris – Ditransfer dari en.wikibooks ke Commons. (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia