NS perbedaan utama antara elektroforesis gel dan SDS PAGE adalah bahwa elektroforesis gel adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan DNA, RNA, dan protein sedangkan SDS PAGE adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan terutama untuk memisahkan protein. Secara umum, SDS PAGE memberikan resolusi yang lebih baik daripada elektroforesis gel biasa.

Elektroforesis Gel dan SDS PAGE adalah teknik dalam bioteknologi yang membantu pemisahan makromolekul berdasarkan muatan dan ukurannya. Biasanya, elektroforesis gel menggunakan tusukan gel agarosa untuk pemisahan sementara SDS PAGE menggunakan tusukan gel poliakrilamida.

Area Utama yang Dicakup

1. Apa itu Elektroforesis Gel? – Definisi, Prosedur, Pentingnya 2. Apa itu HALAMAN SDS? – Definisi, Prosedur, Pentingnya 3. Apa Persamaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE? – Garis Besar Fitur Umum 4. Apa Perbedaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE – Perbandingan Perbedaan Kunci

Istilah Kunci: Agarosa, DNA, Elektroforesis Gel, Poliakrilamida, Protein, SDS PAGE

Apa itu Elektroforesis Gel?

Elektroforesis gel merupakan teknik pemisahan fragmen makromolekul seperti DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Selama elektroforesis gel, makromolekul bergerak di bawah pengaruh medan listrik pada matriks gel, yang berisi pori-pori tempat makromolekul bergerak. Elektroforesis gel adalah teknik umum yang menganalisis DNA dari teknik PCR, RFLP, kloning, sekuensing DNA atau blotting. Nanopartikel juga dapat dipisahkan dengan elektroforesis gel. Gel stab dibuat dari polisakarida yang disebut agarosa yang berasal dari rumput laut. Gel agarosa terdiri dari molekul agarosa rantai panjang yang saling terkait sebagai jaring laba-laba. Video 1 menjelaskan persiapan gel agarosa.

Baik DNA dan RNA mengandung gugus fosfat pada masing-masing nukleotida monomernya. Oleh karena itu, mereka memiliki muatan negatif yang sama di seluruh molekul. Selain itu, mereka bermigrasi menuju elektroda positif di bawah medan listrik. Kecepatan migrasi tergantung pada ukuran asam nukleat. Molekul yang lebih pendek bermigrasi lebih cepat melalui pori-pori sementara yang lebih besar membutuhkan waktu.

Gambar 1: Pita DNA pada Gel Agarosa

Apa itu HALAMAN SDS?

SDS PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis) adalah teknik analisis yang digunakan untuk memisahkan molekul bermuatan berdasarkan ukurannya. Dalam proses ini, SDS digunakan untuk mengisolasi protein dengan mendenaturasinya. Karena SDS adalah deterjen; struktur tersier protein terganggu olehnya, membawa protein yang terlipat menjadi molekul linier. Juga, ia melapisi molekul protein linier itu dengan muatan negatif yang seragam. SDS PAGE terdiri dari dua gel dengan konsentrasi yang berbeda. Lapisan atas disebut gel susun tempat sampel dimuat sedangkan lapisan bawah disebut gel pengurai. Konsentrasi poliakrilamida gel susun adalah 3,5-4% (ukuran pori besar) dan mengkonsentrasikan protein dalam satu pita. Konsentrasi poliakrilamida dalam gel pelarut adalah 4-20% (ukuran pori kecil) dan memisahkan protein berdasarkan ukurannya. Video 2 menunjukkan persiapan HALAMAN SDS.

SDS PAGE menyediakan pemisahan protein yang cepat, membantu analisis selanjutnya seperti Western blotting.

Gambar 2: Pita Protein pada SDS PAGE

Karena daya urai SDS PAGE lebih tinggi daripada gel agarosa biasa, SDS PAGE membantu memisahkan fragmen DNA kecil dengan ukuran 5-500 bp.

Persamaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE

Perbedaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE

Definisi

Elektroforesis Gel: Teknik yang digunakan untuk memisahkan fragmen makromolekul seperti DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya

HALAMAN SDS: Teknik analisis yang digunakan untuk memisahkan molekul bermuatan berdasarkan ukurannya

Komposisi

Elektroforesis Gel: Sama di seluruh gel; terbuat dari agarosa

HALAMAN SDS: Dua gel dengan konsentrasi berbeda; terbuat dari poliakrilamida

Jalankan Konfigurasi

Elektroforesis Gel: Lari horizontal

HALAMAN SDS: lari vertikal

Metodologi Pengecoran

Elektroforesis Gel: Tetapkan saat dingin

HALAMAN SDS: Ditetapkan oleh reaksi kimia

Ukuran Pori

Elektroforesis Gel: Ukuran pori tidak seragam; semakin tinggi konsentrasi agarosa, semakin kecil ukuran pori

HALAMAN SDS: Ukuran pori seragam; rasio akrilamida dengan bis-akrilamida menentukan ukuran pori

Konsentrasi

Elektroforesis Gel: 0.5-2%

HALAMAN SDS: 6-15%

Pemisahan

Elektroforesis Gel: 50-20.000 bp asam nukleat

HALAMAN SDS: 5-250, 000 protein Da

Kondisi

Elektroforesis Gel: Umumnya dijalankan dalam kondisi asli

HALAMAN SDS: Kondisi denaturasi

Persiapan

Elektroforesis Gel: Sederhana

HALAMAN SDS: Proses yang kompleks

pewarnaan

Elektroforesis Gel: Dengan etidium bromida

HALAMAN SDS: Pewarnaan Coomassie atau pewarnaan perak

Kesimpulan

Elektroforesis gel merupakan teknik analisis yang memisahkan makromolekul seperti DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukurannya. SDS PAGE adalah jenis elektroforesis gel yang terutama digunakan untuk memisahkan protein dalam kondisi denaturasi. SDS PAGE memiliki daya pisah yang lebih tinggi jika dibandingkan dengan elektroforesis gel biasa. Perbedaan utama antara elektroforesis gel dan SDS PAGE adalah jenis makromolekul yang dipisahkan dan prosedurnya.

Referensi:

1. "Elektroforesis Gel." Khan Academy, Tersedia Di Sini2. “Elektroforesis Gel Poliakrilamida SDS (SDS-PAGE).” Diamantina Institute, 26 April 2017, Tersedia Di Sini

Gambar Courtesy:

1. "Gel elektroforesis 2" Von Mnolf - Foto diambil di Innsbruck, Austria (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia 2. "Coomassie3" Oleh Yikrazuul - Karya sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia