NS perbedaan utama antara perbaikan ketidakcocokan dan perbaikan eksisi nukleotida adalah bahwa perbaikan ketidakcocokan (MMR) bertanggung jawab untuk menghilangkan ketidakcocokan basa dan loop penyisipan/penghapusan kecil yang diperkenalkan selama replikasi DNA, sedangkan perbaikan eksisi nukleotida (NER) bertanggung jawab untuk menghilangkan berbagai kerusakan DNA yang terjadi karena radiasi ultraviolet. Selanjutnya, sel menjalani perbaikan ketidakcocokan segera setelah sintesis DNA sementara sel menjalani perbaikan eksisi nukleotida jika DNA rusak.

Perbaikan ketidakcocokan dan perbaikan eksisi nukleotida adalah dua mekanisme yang mencegah mutasi dan perubahan permanen lainnya dalam urutan DNA.

Kerusakan DNA, Perbaikan DNA, Perbaikan Ketidakcocokan (MMR), Perbaikan Eksisi Nukleotida (NER), Kesalahan Replikasi

Apa itu Perbaikan Ketidakcocokan

Perbaikan mismatch (MMR) adalah mekanisme perbaikan DNA yang terjadi tepat setelah replikasi DNA. Oleh karena itu, tujuan utama dari mekanisme ini adalah untuk menghapus dan mengganti basa yang tidak berpasangan, yang tidak diperbaiki dengan proofreading. Selain itu, ia mendeteksi dan mengoreksi penyisipan dan penghapusan kecil yang terjadi karena slip DNA polimerase.

Gambar 1: Mekanisme Perbaikan Ketidakcocokan

Biasanya, tiga protein dalam sistem perbaikan ketidakcocokan E. coli adalah MutS, MutL, dan MutH. Di sisi lain, eukariota hanya mengandung homolog MutS dan MutL. Pada manusia, heterodimer homolog MutS, MSH2-MSH6 mengikat ketidakcocokan sementara MSH2-MSH6 dan MSH2-MSH3 dapat mengikat loop penyisipan/penghapusan. Kemudian, untaian yang baru disintesis didegradasi, menghilangkan ketidakcocokan oleh aksi EXO1. Setelah itu, resintesis DNA dan ligasi melengkapi ketidakcocokan.

Apa itu Perbaikan Eksisi Nukleotida?

Perbaikan eksisi nukleotida (NER) adalah mekanisme perbaikan DNA untuk menghilangkan dan mengganti nukleotida yang rusak. Umumnya, mekanisme ini mendeteksi dan memperbaiki kerusakan DNA, yang mendistorsi heliks ganda DNA. Itu adalah; jalur ini mendeteksi nukleotida dan memodifikasi dengan kelompok kimia besar yang melekat pada DNA seperti bahan kimia dalam asap rokok. Selanjutnya, jalur perbaikan eksisi nukleotida memperbaiki kerusakan DNA yang disebabkan oleh radiasi UV. Di sini, radiasi UV membuat basa timin dan sitosin bereaksi dengan nukleotida yang berdekatan. Namun, ikatan yang dihasilkan mendistorsi heliks ganda, menyebabkan kesalahan dalam replikasi DNA. Di sini, jenis ikatan yang paling umum adalah dimer timin, yang terdiri dari dua nukleotida timin yang direaksikan bersama.

Gambar 2: Perbaikan Eksisi Nukleotida

Persamaan Antara Perbaikan Ketidakcocokan dan Perbaikan Eksisi Nukleotida

Perbedaan Antara Perbaikan Ketidakcocokan dan Perbaikan Eksisi Nukleotida

Definisi

Perbaikan ketidakcocokan (MMR) mengacu pada sistem perbaikan DNA di mana satu anggota dari pasangan basa yang tidak cocok diubah menjadi basa yang biasanya cocok sementara perbaikan eksisi nukleotida (NER) mengacu pada jalur utama yang digunakan oleh mamalia untuk menghilangkan lesi DNA yang besar seperti yang dibentuk oleh sinar UV.

Makna

Sel menjalani perbaikan ketidakcocokan segera setelah sintesis DNA sementara sel menjalani perbaikan eksisi nukleotida dengan terjadinya kerusakan DNA.

Jenis Perbaikan

Perbaikan ketidakcocokan menggantikan ketidakcocokan dan loop penyisipan/penghapusan, yang tidak diperbaiki dengan proofreading sementara perbaikan eksisi nukleotida menggantikan kerusakan DNA yang dibentuk oleh radiasi UV atau bahan kimia dalam asap rokok.

Eksisi oleh

Exonuclease 1 mengeluarkan DNA yang tidak cocok dalam mekanisme perbaikan ketidakcocokan sementara faktor transkripsi, XPG dan XPF-ERCC1 mengeluarkan DNA yang rusak dalam mekanisme perbaikan eksisi nukleotida.

Kesimpulan

Perbaikan ketidakcocokan adalah mekanisme perbaikan DNA, menggantikan ketidakcocokan dan loop penyisipan/penghapusan yang tergabung selama replikasi DNA. Umumnya, ketidakcocokan ini adalah yang lolos selama proofreading. Di sisi lain, perbaikan eksisi nukleotida adalah mekanisme lain dari perbaikan DNA, yang menggantikan DNA yang rusak dengan radiasi UV. Oleh karena itu, perbaikan ketidakcocokan terjadi tepat setelah replikasi DNA. Namun, mekanisme perbaikan eksisi nukleotida terjadi dengan terjadinya kerusakan DNA. Fungsi utama dari kedua mekanisme tersebut adalah untuk mencegah mutasi dan perubahan permanen lainnya pada DNA. Dengan demikian, perbedaan utama antara perbaikan mismatch dan perbaikan eksisi nukleotida adalah jenis perbaikannya.

Referensi:

1. Flek, O. “Perbaikan DNA.” Jurnal Ilmu Sel, vol. 117, tidak. 4, 2004, hlm. 515–517., doi:10.1242/jcs.00952.

Gambar Courtesy:

1. "Perbaikan ketidakcocokan DNA Ecoli" Oleh Kenji Fukui (CC BY 4.0) melalui Commons Wikimedia 2. "Nucleotide Excision Repair-journal.pbio.0040203.g001" Oleh Jill O. Fuss, Priscilla K. Cooper (CC BY 2.5) melalui Wikimedia Commons